Крылья птерозавров образовывали складки кожи, которые были натянуты между длинными пальцами передних конечностей и боками этих древних ящеров. Полеты позволяла осуществлять облегченная конструкция скелета, состоявшего из тонких полых костей и лёгкого черепа с многочисленными полостями. Так же как и у птиц, грудина птерозавра имела киль.
Благодаря отлично развитой махательной мускулатуре, птерозавры могли совершать достаточно дальние перелеты и господствовали в воздухе. Тем не менее, эти рептилии вели полуводный образ жизни, на что указывают их перепончатые лапы.
Другой характерной особенностью птерозавров были вытянутые в клюв челюсти. У многих видов имелись острые зубы, однако некоторые поздние формы, в частности, птеранодоны, имели беззубые челюсти. Зубы отдельных разновидностей предназначались для питания планктоном.